Die Tradition der Protestanten in Lyon ist lang und untrennbar mit dem Ablauf der Stadt selbst. Im 16. Zeitalter erlebte Lyon eine Aufschwung des Calvinismus, wobei zahlreiche Händler und gebildete Persönlichkeiten sich dem neuen Bekenntnis zuwandten. Diese frühe Präsenz führte zu einer aktiven reformierten Kirche, die jedoch auch große Repre